ダイアログの「OK」ボタンがアクティブな場合、カーソルの位置に関係なくMB2(マウスの中ボタン)で実行できます。
しかし、表示されたアラートや情報ウィンドウの「OK」ボタンがアクティブな場合、NX2206以降ではアラートや情報ウィンドウの上にカーソルを置かないと、MB2が実行できません。
なお、NX11では、カーソルの位置に関係なくMB2で実行できます。
この問題は、NXの不具合によるものです。
修正バージョンが決まり次第、記事を更新します。