モデリングモードでオブジェクトを透過(transparent)表示にして保存できない。
PSの仕様でモデルレベルで保存することは推奨しておりません。
無理矢理保存することはできますが、Standard表示戻すことができなくなります。
透過表示の保存はstudyレベルで保存することを想定して作成されており、このふるまいは仕様です。